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1.
Braz J Biol ; 83: e272095, 2023.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38055574

RESUMO

This study evaluated the antimicrobial efficacy of a new intracanal drug based on Pentaclethra macroloba extract, a plant of Amazonian origin, against Enterococcus faecalis using macrodilution test and intratubular evaluation with Confocal Laser Scanning Microscopy (CLSM). The minimum inhibitory concentration (MIC) and the minimum bactericidal concentration (MBC) of the pure extract of Pentaclethra macroloba andits association with calcium hydroxide and ultracall were determined. Then, thirty-three dentin cylinders were prepared and inoculated with E. faecalis, to evaluate the antimicrobial effect of the medications on the dentinal tubules with CLSM. The data was analyzed using the Kruskal-Wallis and Dunn tests. The extract in association with calcium hydroxide showed a lower CBM, and in the intratubular test all tested medications were effective against E. faecalis (P >0.05). The new intracanal drug based on P. macroloba extract has an antimicrobial effect against E. faecalis and further studies are needed for its clinical use.


Assuntos
Anti-Infecciosos , Hidróxido de Cálcio , Hidróxido de Cálcio/farmacologia , Extratos Vegetais/farmacologia , Enterococcus faecalis , Anti-Infecciosos/farmacologia
2.
Braz J Biol ; 83: e273525, 2023.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37909556

RESUMO

The Baixada Maranhense Environmental Protection Area of the Brazilian state of Maranhão encompasses a biologically rich region that includes the basins of four principal rivers, the Mearim, Pericumã, Pindaré, and Turiaçu, which form a complex of wetlands. The present study provides a comprehensive inventory of the fish fauna of the rivers that drain the Baixada Maranhense based on the identification of voucher specimens that were deposited in a scientific collection. Expeditions were conducted between 2014 and 2020. The inventory identified a total of 100 fish species representing 79 genera, 34 families, and 11 orders, which are found in both freshwater and estuarine environments. Six (Potamotrygon orbignyi, Leporinus piau, Moenkhausia loweae, Serrasalmus spilopleura, Pachypops fourcroi and Peckoltia greedoi) of the 100 taxa identified here are considered to be new records for one or more of the basins surveyed during this study, based on the existing data, while four - Colossoma macropomum, Megaleporinus macrocephalus, Cichla sp. and Cichla kelberi - are not native. The most speciose orders were the Siluriformes and Characiformes, while the most diverse families were the Loricariidae, Characidae, Auchenipteridae, Cichlidae, and Serrasalmidae. These data are consistent with the findings of most of the previous studies of freshwater ecosystems in the Neotropical region, in particular those of the rivers of Maranhão. The results of the present study represent an important advance in the understanding of the diversity of the fish fauna of the Mearim, Pericumã, Pindaré, and Turiaçu rivers, which are still poorly studied, and have likely had their diversity underestimated up to now.


Assuntos
Peixes-Gato , Characidae , Caraciformes , Ciclídeos , Humanos , Animais , Brasil , Ecossistema , Rios
3.
J Chem Phys ; 156(21): 214501, 2022 Jun 07.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35676139

RESUMO

Soret effect and diffusion in triethylene glycol (TEG)-water mixtures were investigated as a function of concentration at 25 °C by means of optical digital interferometry, with the use of a classical Soret cell. Diffusion D, thermal diffusion DT, and Soret ST coefficients are described for the full concentration range and an analysis is made individually for TEG-water mixture and within a series of n-ethylene glycol (n-EG) aqueous systems. All coefficients decrease with increasing the concentration of TEG and n-EG. ST shows a change of sign with concentration, and this change is directly related to the ability of the n-EG molecule to establish hydrogen bonding with water. Diffusion and thermal diffusion coefficients present a plateau behavior with increasing concentration, showing the occurrence of changes in the preferential interactions in aqueous solution with concentration and meaning that, at high TEG composition, ether oxygens can be involved in the molecular interactions.


Assuntos
Etilenoglicol , Água , Difusão , Polietilenoglicóis
4.
Braz. j. biol ; 82: e232868, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1153458

RESUMO

The "piaussu", Megaleporinus macrocephalus is an anostomatid fish species native to the basin of the Paraguay River, in the Pantanal biome of western Brazil. However, this species has now been recorded in a number of other drainages, including those of the upper Paraná, Uruguay, Jacuí, Doce, Mucuri, and Paraíba do Sulrivers. This study presents two new records of the occurrence of M. macrocephalus, in the basins of the Itapecuru and Mearim rivers in the state of Maranhão, in the Brazilian Northeast. The piaussu is a large-bodied fish of commercial interest that is widely raised on fish farms, and its occurrence in the Itapecuru and Mearim rivers is likely the result of individuals escaping from fish tanks when they overflow during the rainy season. Morphological analyses and sequences of the Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) gene confirmed the taxonomic identification of the specimens as M. macrocephalus. The COI sequences were 99.66% similar to those of M. macrocephalus deposited in the BOLDSystems database. These records extend the known distribution of M. macrocephalus to the basins of the Itapecuru and Mearim rivers in the Brazilian Northeast, highlighting a new case of introduction of exotic fish species into Brazilian river basins.


Megaleporinus macrocephalus é uma espécie de peixe anostomatídeo nativa da bacia do rio Paraguai, no bioma Pantanal do oeste do Brasil. No entanto, essa espécie já foi registrada em várias outras drenagens, incluindo as dos rios Alto Paraná, Uruguai, Jacuí, Doce, Mucuri e Paraíba do Sul. Este estudo apresenta dois novos registros da ocorrência de M. macrocephalus, nas bacias dos rios Itapecuru e Mearim, no estado do Maranhão, no nordeste brasileiro. O piaussu é um peixe de grande porte, de interesse comercial, amplamente criado em pisciculturas, e sua ocorrência nos rios Itapecuru e Mearim é provavelmente o resultado de indivíduos que escapam dos tanques quando transbordam durante a estação chuvosa. Análises morfológicas e sequências do gene da subunidade I do citocromo oxidase (COI) confirmaram a identificação taxonômica dos espécimes como M. macrocephalus. As sequências de COI foram 99,66% semelhantes às de M. macrocephalus depositadas no banco de dados BOLDSystems. Esses registros estendem a conhecida distribuição de M. macrocephalus às bacias dos rios Itapecuru e Mearim, no nordeste brasileiro, destacando um novo caso de introdução de espécies exóticas de peixes nas bacias hidrográficas brasileiras.


Assuntos
Humanos , Animais , Rios , Caraciformes/genética , Paraguai , Uruguai , Brasil
5.
Braz. j. biol ; 82: 1-6, 2022. map, tab, ilus
Artigo em Inglês | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1468418

RESUMO

The "piaussu", Megaleporinus macrocephalus is an anostomatid fish species native to the basin of the Paraguay River, in the Pantanal biome of western Brazil. However, this species has now been recorded in a number of other drainages, including those of the upper Paraná, Uruguay, Jacuí, Doce, Mucuri, and Paraíba do Sulrivers. This study presents two new records of the occurrence of M. macrocephalus, in the basins of the Itapecuru and Mearim rivers in the state of Maranhão, in the Brazilian Northeast. The piaussu is a large-bodied fish of commercial interest that is widely raised on fish farms, and its occurrence in the Itapecuru and Mearim rivers is likely the result of individuals escaping from fish tanks when they overflow during the rainy season. Morphological analyses and sequences of the Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) gene confirmed the taxonomic identification of the specimens as M. macrocephalus. The COI sequences were 99.66% similar to those of M. macrocephalus deposited in the BOLDSystems database. These records extend the known distribution of M. macrocephalus to the basins of the Itapecuru and Mearim rivers in the Brazilian Northeast, highlighting a new case of introduction of exotic fish species into Brazilian river basins.


Megaleporinus macrocephalus é uma espécie de peixe anostomatídeo nativa da bacia do rio Paraguai, no bioma Pantanal do oeste do Brasil. No entanto, essa espécie já foi registrada em várias outras drenagens, incluindo as dos rios Alto Paraná, Uruguai, Jacuí, Doce, Mucuri e Paraíba do Sul. Este estudo apresenta dois novos registros da ocorrência de M. macrocephalus, nas bacias dos rios Itapecuru e Mearim, no estado do Maranhão, no nordeste brasileiro. O piaussu é um peixe de grande porte, de interesse comercial, amplamente criado em pisciculturas, e sua ocorrência nos rios Itapecuru e Mearim é provavelmente o resultado de indivíduos que escapam dos tanques quando transbordam durante a estação chuvosa. Análises morfológicas e sequências do gene da subunidade I do citocromo oxidase (COI) confirmaram a identificação taxonômica dos espécimes como M. macrocephalus. As sequências de COI foram 99,66% semelhantes às de M. macrocephalus depositadas no banco de dados BOLDSystems. Esses registros estendem a conhecida distribuição de M. macrocephalus às bacias dos rios Itapecuru e Mearim, no nordeste brasileiro, destacando um novo caso de introdução de espécies exóticas de peixes nas bacias hidrográficas brasileiras.


Assuntos
Animais , Peixes/anatomia & histologia , Peixes/genética
6.
Braz. j. biol ; 822022.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1468605

RESUMO

Abstract The piaussu, Megaleporinus macrocephalus is an anostomatid fish species native to the basin of the Paraguay River, in the Pantanal biome of western Brazil. However, this species has now been recorded in a number of other drainages, including those of the upper Paraná, Uruguay, Jacuí, Doce, Mucuri, and Paraíba do Sulrivers. This study presents two new records of the occurrence of M. macrocephalus, in the basins of the Itapecuru and Mearim rivers in the state of Maranhão, in the Brazilian Northeast. The piaussu is a large-bodied fish of commercial interest that is widely raised on fish farms, and its occurrence in the Itapecuru and Mearim rivers is likely the result of individuals escaping from fish tanks when they overflow during the rainy season. Morphological analyses and sequences of the Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) gene confirmed the taxonomic identification of the specimens as M. macrocephalus. The COI sequences were 99.66% similar to those of M. macrocephalus deposited in the BOLDSystems database. These records extend the known distribution of M. macrocephalus to the basins of the Itapecuru and Mearim rivers in the Brazilian Northeast, highlighting a new case of introduction of exotic fish species into Brazilian river basins.


Resumo Megaleporinus macrocephalus é uma espécie de peixe anostomatídeo nativa da bacia do rio Paraguai, no bioma Pantanal do oeste do Brasil. No entanto, essa espécie já foi registrada em várias outras drenagens, incluindo as dos rios Alto Paraná, Uruguai, Jacuí, Doce, Mucuri e Paraíba do Sul. Este estudo apresenta dois novos registros da ocorrência de M. macrocephalus, nas bacias dos rios Itapecuru e Mearim, no estado do Maranhão, no nordeste brasileiro. O piaussu é um peixe de grande porte, de interesse comercial, amplamente criado em pisciculturas, e sua ocorrência nos rios Itapecuru e Mearim é provavelmente o resultado de indivíduos que escapam dos tanques quando transbordam durante a estação chuvosa. Análises morfológicas e sequências do gene da subunidade I do citocromo oxidase (COI) confirmaram a identificação taxonômica dos espécimes como M. macrocephalus. As sequências de COI foram 99,66% semelhantes às de M. macrocephalus depositadas no banco de dados BOLDSystems. Esses registros estendem a conhecida distribuição de M. macrocephalus às bacias dos rios Itapecuru e Mearim, no nordeste brasileiro, destacando um novo caso de introdução de espécies exóticas de peixes nas bacias hidrográficas brasileiras.

7.
Braz. j. biol ; 81(4): 917-927, Oct.-Dec. 2021. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1153455

RESUMO

Abstract The trahira or wolf fish - Hoplias malabaricus- is a valid species, although recent cytogenetic and molecular studies have indicated the existence of a species complex. In this context, the present study analyzed the mitochondrial COI marker to determine the levels of genetic diversity of specimens from the Brazilian state of Maranhão, and verify the occurrence of distinct lineages within the study area. Samples were collected from the basins of the Turiaçu, Pindaré, Mearim, Itapecuru, and Parnaíba rivers. A 630-bp fragment was obtained from 211 specimens, with 484 conserved and 108 variable sites, and 60 haplotypes (Hd = 0,947; π = 0,033). The phylogenetic analyses indicated the existence of three distinct lineages of H. malabaricus from Maranhão. Genetic distances of 1.5-8.2% were found between all the populations analyzed, while the variation between haplogroups ranged from 2.1% to 7.7%. The AMOVA indicated that most of the molecular variation was found among groups, with high FST values. The high levels of genetic variability found in the present study are supported by the available cytogenetic data. These findings reinforce the need for the development of effective programs of conservation and management independently for each river basin, in order to preserve the genetic variability found in this taxon.


Resumo A traíra - Hoplias malabaricus- é uma espécie válida, embora recentes estudos citogenéticos e moleculares tenham indicado a existência de um complexo de espécies. Neste contexto, o presente estudo analisou o marcador mitocondrial COI para determinar os níveis de diversidade genética dos espécimes do estado do Maranhão e verificar a ocorrência de linhagens distintas dentro da área de estudo. As amostras foram coletadas nas bacias dos rios Turiaçu, Pindaré, Mearim, Itapecuru e Parnaíba. As análises filogenéticas indicaram a existência de três linhagens distintas nas populações do Maranhão. Obteve-se um fragmento de 630 pb de 211 espécimes, com 484 sítios conservados, 108 variáveis e 60 haplótipos (Hd = 0,947; π = 0,033). As análises filogenéticas indicaram a ocorrência de três linhagens distintas de H. malabaricus do Maranhão. Distâncias genéticas de 1.5 a 8.2% foram encontradas entre todas as populações analisadas, enquanto a variação entre os haplogrupos variou de 2.1% a 7.7%. A AMOVA indicou que a maior variação molecular foi entre os grupos, com altos valores de FST. Os altos níveis de variabilidade genética encontrados no presente estudo são suportados pelos dados citogenéticos disponíveis. Essas descobertas reforçam a necessidade de desenvolver programas de conservação e manejo independentemente para cada bacia hidrográfica, a fim de preservar a variabilidade genética encontrada neste táxon.


Assuntos
Animais , Código de Barras de DNA Taxonômico , Caraciformes/genética , Filogenia , Variação Genética/genética , Haplótipos/genética , Brasil , Rios
8.
Braz J Biol ; 82: e232868, 2021.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33681896

RESUMO

The "piaussu", Megaleporinus macrocephalus is an anostomatid fish species native to the basin of the Paraguay River, in the Pantanal biome of western Brazil. However, this species has now been recorded in a number of other drainages, including those of the upper Paraná, Uruguay, Jacuí, Doce, Mucuri, and Paraíba do Sulrivers. This study presents two new records of the occurrence of M. macrocephalus, in the basins of the Itapecuru and Mearim rivers in the state of Maranhão, in the Brazilian Northeast. The piaussu is a large-bodied fish of commercial interest that is widely raised on fish farms, and its occurrence in the Itapecuru and Mearim rivers is likely the result of individuals escaping from fish tanks when they overflow during the rainy season. Morphological analyses and sequences of the Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) gene confirmed the taxonomic identification of the specimens as M. macrocephalus. The COI sequences were 99.66% similar to those of M. macrocephalus deposited in the BOLDSystems database. These records extend the known distribution of M. macrocephalus to the basins of the Itapecuru and Mearim rivers in the Brazilian Northeast, highlighting a new case of introduction of exotic fish species into Brazilian river basins.


Assuntos
Caraciformes , Rios , Animais , Brasil , Caraciformes/genética , Humanos , Paraguai , Uruguai
9.
Braz J Biol ; 81(4): 917-927, 2021.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33053129

RESUMO

The trahira or wolf fish - Hoplias malabaricus- is a valid species, although recent cytogenetic and molecular studies have indicated the existence of a species complex. In this context, the present study analyzed the mitochondrial COI marker to determine the levels of genetic diversity of specimens from the Brazilian state of Maranhão, and verify the occurrence of distinct lineages within the study area. Samples were collected from the basins of the Turiaçu, Pindaré, Mearim, Itapecuru, and Parnaíba rivers. A 630-bp fragment was obtained from 211 specimens, with 484 conserved and 108 variable sites, and 60 haplotypes (Hd = 0,947; π = 0,033). The phylogenetic analyses indicated the existence of three distinct lineages of H. malabaricus from Maranhão. Genetic distances of 1.5-8.2% were found between all the populations analyzed, while the variation between haplogroups ranged from 2.1% to 7.7%. The AMOVA indicated that most of the molecular variation was found among groups, with high FST values. The high levels of genetic variability found in the present study are supported by the available cytogenetic data. These findings reinforce the need for the development of effective programs of conservation and management independently for each river basin, in order to preserve the genetic variability found in this taxon.


Assuntos
Caraciformes , Código de Barras de DNA Taxonômico , Animais , Brasil , Caraciformes/genética , Variação Genética/genética , Haplótipos/genética , Filogenia , Rios
10.
Braz. j. biol ; 80(2): 405-409, Apr.-June 2020. graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1132374

RESUMO

Abstract Based on morphological and molecular data, we present the first record of Cynomops planirostris for the State of Maranhão. The specimen was collected in the Inhamum Municipal Environmental Protection Area in Maranhão, Brazil and characterized morphologically as an adult male with scrotal testicles, dorsal pelage reddish chestnut, with ventral pelage slightly lighter in color, forearm length 34.70-34.80mm dental formula i:1/1, c:1/1, pm:1/2, m:3/3 = 26. The sequence of the Cytochrome Oxidase I subunit (COI) molecular marker confirmed the morphological diagnosis of the specimen as C. planirostris with significant similarities. The combined analysis of both morphological and molecular confirmed the occurrence of C. planirostris in the Brazilian state of Maranhão, in the Cerrado biome and records extends the known geographic distribution of the species by 411.30 km.


Resumo Com base em dados morfológicos e moleculares apresenta-se o primeiro registro de Cynomops planirostris para o Estado do Maranhão. O espécime foi coletado na Área de Proteção Ambiental Municipal do Inhamum, no Maranhão, Brasil e caracterizado morfologicamente como um macho adulto com testículos escrotal, coloração da pelagem dorsal castanho avermelhado, pelagem ventral levemente mais clara, comprimento do antebraço variando de 34,70-34,80mm, fórmula dentária: i:1/1, c:1/1, pm:1/2, m:3/3=26. A sequência do marcador molecular Citocromo Oxidase subunidade I (COI) confirmou a diagnose morfológica do espécime com C. planirostris com significante similaridade. A combinação dos dados morfológicos e moleculares confirmou a ocorrência da espécie C. planirostris para o estado brasileiro do Maranhão, no bioma Cerrado e registra a distribuição geográfica da espécie em 411.30 Km.


Assuntos
Animais , Masculino , Quirópteros , Brasil , Ecossistema
11.
Braz J Biol ; 80(2): 405-409, 2020.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31389486

RESUMO

Based on morphological and molecular data, we present the first record of Cynomops planirostris for the State of Maranhão. The specimen was collected in the Inhamum Municipal Environmental Protection Area in Maranhão, Brazil and characterized morphologically as an adult male with scrotal testicles, dorsal pelage reddish chestnut, with ventral pelage slightly lighter in color, forearm length 34.70-34.80mm dental formula i:1/1, c:1/1, pm:1/2, m:3/3 = 26. The sequence of the Cytochrome Oxidase I subunit (COI) molecular marker confirmed the morphological diagnosis of the specimen as C. planirostris with significant similarities. The combined analysis of both morphological and molecular confirmed the occurrence of C. planirostris in the Brazilian state of Maranhão, in the Cerrado biome and records extends the known geographic distribution of the species by 411.30 km.


Assuntos
Quirópteros , Animais , Brasil , Ecossistema , Masculino
12.
Braz. j. biol ; 79(4): 594-602, Nov. 2019. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-1001493

RESUMO

Abstract Didelphis albiventris are found throughout Northeast and Central Brazil to central-southern Uruguay and it was subject of few studies in a population level. Given this, the present study investigated the genetic variability of the species using the mitochondrial molecular marker cytochrome oxidase c subunit I. We analyzed samples from the different biomes within three Brazilian regions: Northeast (Caatinga , Cerrado, and Atlantic Forest), Southeast (Cerrado , Atlantic Forest, Cerrado/Atlantic Forest, and Cerrado/Caatinga ecotones) and South (Pampa and Atlantic Forest). Software BAPs retrieved five distinct demes: dm 1, dm 2, and dm 5 that occurs in South, Northeast and Southeast regions respectively and the dm 3 and dm 4 are wide distributed in Northeast and Southeast. Population analysis performed with AMOVA, haplotype network and Mantel test estimated the veracity of the demes. The FST shows structuring for the five demes, with dm 1 (South region) isolated from the others, however the other analysis showed the Northeast/Southeast demes (dm 2-5) united, diagnosing gene flow between them, mainly at the transitional zones, in areas as far away as areas with similar latitude interval (Southeast vs South) that was not detected gene flow. In the haplotype network, the mutational steps was conclusive in split dm1 from dm 2-5 with 15 mutational steps and the Mantel test was moderated, which is explained by genetic similarity despite the great geographic distances (Northeast/Southeast). Thus, our analysis recognized two different lineages (South and Northeast/Southeast) and indicate that the biomes were not decisive in their isolation. The sharing of demes at the transitional zones and in areas with high latitudinal intervals reflects a recent ancestral polymorphism for D. albiventris. The plasticity in the occupation of the space by this species contributes in its wide dispersion capability, that is, geographical distribution. Our results revealed important implications for the management of D. albiventris in these transitional zones areas where demes were shared.


Resumo Didelphis albiventris é encontrada em todo o Nordeste e região central do Brasil até o centro-sul do Uruguai e foi alvo de poucos estudos em nível populacional. Dessa forma, o presente estudo, investiga a variabilidade genética da espécie usando o marcador molecular citocromo c oxidase subunidade I. Analisou-se amostras de diferentes biomas de três regiões brasileiras: Nordeste (Caatinga, Cerrado e Floresta Atlântica), Sudeste (Cerrado, Floresta Atlântica, ecótonos Cerrado/Floresta Atlântica e Cerrado/Caatinga) e Sul (Pampa e Floresta Atlântica). O software BAPs recuperou cinco demes distintos: dm 1, dm 2 e dm 5, que ocorrem nas regiões Sul, Nordeste e Sudeste, respectivamente, e os dm 3 e dm 4, que são amplamente distribuído no Nordeste e Sudeste. Análises populacionais realizadas com AMOVA, rede de haplótipo e teste de Mantel estimaram a veracidade das demes. O FST mostrou estruturação para as cinco demes, com dm 1 (região Sul) isolada das demais, entretanto as outras análises mostraram as demes Nordeste/Sudeste (dm 2-5) unidos, diagnosticando fluxo gênico entre elas, principalmente em zonas de transição, em áreas tão distante quanto áreas com similar intervalo de latitude (Sudeste e Sul), onde não foram detectado fluxo gênico. Na rede de haplótipo, os passos mutacionais foram conclusivos em separar dm 1 do dm 2-5 com 15 passos mutacionais, e o teste de Mantel foi moderado, o que é explicado pela similaridade genética apesar da grande distância geográfica (Nordeste/Sudeste). Assim, duas linhagens diferentes (Sul e Sudeste/Nordeste) foram encontradas, indicando que os biomas não foram decisivos em seus isolamentos. Os compartilhamentos das demes, em zonas de transição e em áreas com elevados intervalos de latitude, refletem um polimorfismo ancestral recente para D. albiventris. A plasticidade na ocupação do espaço por esta espécie contribui em sua ampla capacidade de dispersão, ou seja, distribuição geográfica. Nossos resultados revelam importantes implicações para o manejo de D. albiventris nessas áreas de zonas de transição, onde as demes são compartilhadas.


Assuntos
Animais , Variação Genética , Didelphis/genética , Brasil , Complexo IV da Cadeia de Transporte de Elétrons/análise
13.
Arq. bras. med. vet. zootec. (Online) ; 71(2): 640-646, mar.-abr. 2019. ilus
Artigo em Português | VETINDEX, LILACS | ID: biblio-1011283

RESUMO

O objetivo deste trabalho foi padronizar uma PCR para a detecção do Salmo salar, a qual possa ser usada na autenticação do salmão utilizado em pratos da culinária japonesa e do pescado comercializado in natura. Para isso, dois lotes de sushi foram produzidos experimentalmente. Além disso, foram visitados 38 estabelecimentos que comercializam comida japonesa e 10 peixarias na região metropolitana de Belém, visando à coleta do sushi, do temaki e do pescado pertencente à espécie Salmo salar. Os dados demonstraram que a técnica foi eficiente para a autenticação de Salmo salar, visto que a espécie foi detectada tanto nas amostras de sushis preparados experimentalmente quanto nas alíquotas de pescados isolados, utilizados para a preparação do sushi. Em contrapartida, a espécie Salmo trutta não foi detectada nas amostras de sushis preparados com esta espécie nem nas alíquotas de pescado isolado. Além disso, foi possível a confirmação da utilização da espécie Salmo salar no preparo das amostras de sushi, temaki e de pescado. Portanto, concluiu-se que a técnica foi capaz de amplificar o DNA da referida espécie e não gerou identificação inespecífica quando a espécie Salmo trutta foi analisada, podendo ser uma ferramenta adequada para a autenticação do Salmo salar.(AU)


The objective of this work was to standardize a PCR for the detection of Salmo salar, which can be used in the authentication of salmon used in Japanese dishes and fish commercialized in natura. For this, two batches of sushi were produced experimentally. In addition, 38 establishments that sell Japanese food and 10 fishmongers in the metropolitan area of Belém were visited, aiming to collect sushi, temaki and fish belonging to the species Salmo salar. The data demonstrated that the technique was efficient for the authentication of Salmo salar, since the species was detected in both the experimentally prepared sushi samples and the isolated fish aliquots used for the preparation of sushi. In contrast, the species Salmo trutta was not detected in the sushi samples prepared with this species nor in the isolated fish aliquots. In addition, it was possible to confirm the use of the Salmo salar species in the preparation of sushi, temaki and fish samples. Therefore, it was concluded that the technique was able to amplify the DNA of this species and did not generate nonspecific identification when the species Salmo trutta was analyzed, being able to be a suitable tool for the authentication of Salmo salar.(AU)


Assuntos
Animais , Salmo salar/genética , Restaurantes , Reação em Cadeia da Polimerase/veterinária , Alimentos de Origem Animal
14.
Braz J Biol ; 79(4): 594-602, 2019.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30379237

RESUMO

Didelphis albiventris are found throughout Northeast and Central Brazil to central-southern Uruguay and it was subject of few studies in a population level. Given this, the present study investigated the genetic variability of the species using the mitochondrial molecular marker cytochrome oxidase c subunit I. We analyzed samples from the different biomes within three Brazilian regions: Northeast (Caatinga , Cerrado, and Atlantic Forest), Southeast (Cerrado , Atlantic Forest, Cerrado/Atlantic Forest, and Cerrado/Caatinga ecotones) and South (Pampa and Atlantic Forest). Software BAPs retrieved five distinct demes: dm 1, dm 2, and dm 5 that occurs in South, Northeast and Southeast regions respectively and the dm 3 and dm 4 are wide distributed in Northeast and Southeast. Population analysis performed with AMOVA, haplotype network and Mantel test estimated the veracity of the demes. The FST shows structuring for the five demes, with dm 1 (South region) isolated from the others, however the other analysis showed the Northeast/Southeast demes (dm 2-5) united, diagnosing gene flow between them, mainly at the transitional zones, in areas as far away as areas with similar latitude interval (Southeast vs South) that was not detected gene flow. In the haplotype network, the mutational steps was conclusive in split dm1 from dm 2-5 with 15 mutational steps and the Mantel test was moderated, which is explained by genetic similarity despite the great geographic distances (Northeast/Southeast). Thus, our analysis recognized two different lineages (South and Northeast/Southeast) and indicate that the biomes were not decisive in their isolation. The sharing of demes at the transitional zones and in areas with high latitudinal intervals reflects a recent ancestral polymorphism for D. albiventris. The plasticity in the occupation of the space by this species contributes in its wide dispersion capability, that is, geographical distribution. Our results revealed important implications for the management of D. albiventris in these transitional zones areas where demes were shared.


Assuntos
Didelphis/genética , Variação Genética , Animais , Brasil , Complexo IV da Cadeia de Transporte de Elétrons/análise
15.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1467223

RESUMO

Abstract Didelphis albiventris are found throughout Northeast and Central Brazil to central-southern Uruguay and it was subject of few studies in a population level. Given this, the present study investigated the genetic variability of the species using the mitochondrial molecular marker cytochrome oxidase c subunit I. We analyzed samples from the different biomes within three Brazilian regions: Northeast (Caatinga , Cerrado, and Atlantic Forest), Southeast (Cerrado , Atlantic Forest, Cerrado/Atlantic Forest, and Cerrado/Caatinga ecotones) and South (Pampa and Atlantic Forest). Software BAPs retrieved five distinct demes: dm 1, dm 2, and dm 5 that occurs in South, Northeast and Southeast regions respectively and the dm 3 and dm 4 are wide distributed in Northeast and Southeast. Population analysis performed with AMOVA, haplotype network and Mantel test estimated the veracity of the demes. The FST shows structuring for the five demes, with dm 1 (South region) isolated from the others, however the other analysis showed the Northeast/Southeast demes (dm 2-5) united, diagnosing gene flow between them, mainly at the transitional zones, in areas as far away as areas with similar latitude interval (Southeast vs South) that was not detected gene flow. In the haplotype network, the mutational steps was conclusive in split dm1 from dm 2-5 with 15 mutational steps and the Mantel test was moderated, which is explained by genetic similarity despite the great geographic distances (Northeast/Southeast). Thus, our analysis recognized two different lineages (South and Northeast/Southeast) and indicate that the biomes were not decisive in their isolation. The sharing of demes at the transitional zones and in areas with high latitudinal intervals reflects a recent ancestral polymorphism for D. albiventris. The plasticity in the occupation of the space by this species contributes in its wide dispersion capability, that is, geographical distribution. Our results revealed important implications for the management of D. albiventris in these transitional zones areas where demes were shared.


Resumo Didelphis albiventris é encontrada em todo o Nordeste e região central do Brasil até o centro-sul do Uruguai e foi alvo de poucos estudos em nível populacional. Dessa forma, o presente estudo, investiga a variabilidade genética da espécie usando o marcador molecular citocromo c oxidase subunidade I. Analisou-se amostras de diferentes biomas de três regiões brasileiras: Nordeste (Caatinga, Cerrado e Floresta Atlântica), Sudeste (Cerrado, Floresta Atlântica, ecótonos Cerrado/Floresta Atlântica e Cerrado/Caatinga) e Sul (Pampa e Floresta Atlântica). O software BAPs recuperou cinco demes distintos: dm 1, dm 2 e dm 5, que ocorrem nas regiões Sul, Nordeste e Sudeste, respectivamente, e os dm 3 e dm 4, que são amplamente distribuído no Nordeste e Sudeste. Análises populacionais realizadas com AMOVA, rede de haplótipo e teste de Mantel estimaram a veracidade das demes. O FST mostrou estruturação para as cinco demes, com dm 1 (região Sul) isolada das demais, entretanto as outras análises mostraram as demes Nordeste/Sudeste (dm 2-5) unidos, diagnosticando fluxo gênico entre elas, principalmente em zonas de transição, em áreas tão distante quanto áreas com similar intervalo de latitude (Sudeste e Sul), onde não foram detectado fluxo gênico. Na rede de haplótipo, os passos mutacionais foram conclusivos em separar dm 1 do dm 2-5 com 15 passos mutacionais, e o teste de Mantel foi moderado, o que é explicado pela similaridade genética apesar da grande distância geográfica (Nordeste/Sudeste). Assim, duas linhagens diferentes (Sul e Sudeste/Nordeste) foram encontradas, indicando que os biomas não foram decisivos em seus isolamentos. Os compartilhamentos das demes, em zonas de transição e em áreas com elevados intervalos de latitude, refletem um polimorfismo ancestral recente para D. albiventris. A plasticidade na ocupação do espaço por esta espécie contribui em sua ampla capacidade de dispersão, ou seja, distribuição geográfica. Nossos resultados revelam importantes implicações para o manejo de D. albiventris nessas áreas de zonas de transição, onde as demes são compartilhadas.

16.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1467307

RESUMO

Abstract Based on morphological and molecular data, we present the first record of Cynomops planirostris for the State of Maranhão. The specimen was collected in the Inhamum Municipal Environmental Protection Area in Maranhão, Brazil and characterized morphologically as an adult male with scrotal testicles, dorsal pelage reddish chestnut, with ventral pelage slightly lighter in color, forearm length 34.70-34.80mm dental formula i:1/1, c:1/1, pm:1/2, m:3/3 = 26. The sequence of the Cytochrome Oxidase I subunit (COI) molecular marker confirmed the morphological diagnosis of the specimen as C. planirostris with significant similarities. The combined analysis of both morphological and molecular confirmed the occurrence of C. planirostris in the Brazilian state of Maranhão, in the Cerrado biome and records extends the known geographic distribution of the species by 411.30 km.


Resumo Com base em dados morfológicos e moleculares apresenta-se o primeiro registro de Cynomops planirostris para o Estado do Maranhão. O espécime foi coletado na Área de Proteção Ambiental Municipal do Inhamum, no Maranhão, Brasil e caracterizado morfologicamente como um macho adulto com testículos escrotal, coloração da pelagem dorsal castanho avermelhado, pelagem ventral levemente mais clara, comprimento do antebraço variando de 34,70-34,80mm, fórmula dentária: i:1/1, c:1/1, pm:1/2, m:3/3=26. A sequência do marcador molecular Citocromo Oxidase subunidade I (COI) confirmou a diagnose morfológica do espécime com C. planirostris com significante similaridade. A combinação dos dados morfológicos e moleculares confirmou a ocorrência da espécie C. planirostris para o estado brasileiro do Maranhão, no bioma Cerrado e registra a distribuição geográfica da espécie em 411.30 Km.

17.
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1467499

RESUMO

Abstract The trahira or wolf fish - Hoplias malabaricus- is a valid species, although recent cytogenetic and molecular studies have indicated the existence of a species complex. In this context, the present study analyzed the mitochondrial COI marker to determine the levels of genetic diversity of specimens from the Brazilian state of Maranhão, and verify the occurrence of distinct lineages within the study area. Samples were collected from the basins of the Turiaçu, Pindaré, Mearim, Itapecuru, and Parnaíba rivers. A 630-bp fragment was obtained from 211 specimens, with 484 conserved and 108 variable sites, and 60 haplotypes (Hd = 0,947; = 0,033). The phylogenetic analyses indicated the existence of three distinct lineages of H. malabaricus from Maranhão. Genetic distances of 1.5-8.2% were found between all the populations analyzed, while the variation between haplogroups ranged from 2.1% to 7.7%. The AMOVA indicated that most of the molecular variation was found among groups, with high FST values. The high levels of genetic variability found in the present study are supported by the available cytogenetic data. These findings reinforce the need for the development of effective programs of conservation and management independently for each river basin, in order to preserve the genetic variability found in this taxon.


Resumo A traíra - Hoplias malabaricus- é uma espécie válida, embora recentes estudos citogenéticos e moleculares tenham indicado a existência de um complexo de espécies. Neste contexto, o presente estudo analisou o marcador mitocondrial COI para determinar os níveis de diversidade genética dos espécimes do estado do Maranhão e verificar a ocorrência de linhagens distintas dentro da área de estudo. As amostras foram coletadas nas bacias dos rios Turiaçu, Pindaré, Mearim, Itapecuru e Parnaíba. As análises filogenéticas indicaram a existência de três linhagens distintas nas populações do Maranhão. Obteve-se um fragmento de 630 pb de 211 espécimes, com 484 sítios conservados, 108 variáveis e 60 haplótipos (Hd = 0,947; = 0,033). As análises filogenéticas indicaram a ocorrência de três linhagens distintas de H. malabaricus do Maranhão. Distâncias genéticas de 1.5 a 8.2% foram encontradas entre todas as populações analisadas, enquanto a variação entre os haplogrupos variou de 2.1% a 7.7%. A AMOVA indicou que a maior variação molecular foi entre os grupos, com altos valores de FST. Os altos níveis de variabilidade genética encontrados no presente estudo são suportados pelos dados citogenéticos disponíveis. Essas descobertas reforçam a necessidade de desenvolver programas de conservação e manejo independentemente para cada bacia hidrográfica, a fim de preservar a variabilidade genética encontrada neste táxon.

18.
Genet Mol Res ; 15(3)2016 Aug 29.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-27706636

RESUMO

DNA barcoding is a useful complementary tool for use in traditional taxonomic studies due to its ability to detect cryptic species, and may be particularly efficient in the identification of fish species. The fish fauna of the Itapecuru River represents an important fishery resource in the Brazilian State of Maranhão, although it is currently suffering increasing degradation as a result of anthropogenic impacts. Therefore, DNA barcoding was used in the present study to identify fish species and establish a database of the rich freshwater fish fauna of Maranhão. A total of 440 specimens were analyzed, corresponding to 64 species belonging to 59 genera, 31 families, and 10 orders. Overall, 92.19% of these species could be identified by DNA barcoding, and were characterized by low levels (average 0.80%) of intra-specific divergence. However, five species (Anableps anableps, Gymnotus carapo, Sciades couma, Pseudauchenipterus nodosus, and Leporinus piau) presented values of mean genetic divergence above 3%, indicating the existence of cryptic diversity in these fishes. The DNA barcoding approach permitted the analysis of a large number of specimens and facilitated the discrimination and identification of closely related fish species in the Itapecuru Basin.


Assuntos
Código de Barras de DNA Taxonômico/métodos , Complexo IV da Cadeia de Transporte de Elétrons/genética , Proteínas de Peixes/genética , Peixes/genética , Genoma , Filogenia , Animais , Brasil , DNA/genética , Peixes/classificação , Especiação Genética , Variação Genética , Rios
19.
Braz J Biol ; 75(4): 838-45, 2015 Nov.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-26675902

RESUMO

The red piranha, Pygocentrus nattereri, is an important resource for artisanal and commercial fisheries. The present study determines the genetic differentiation among P. nattereri populations from the northeastern Brazilian state of Maranhão. The DNA was isolated using a standard phenol-chloroform protocol and the Control Region was amplified by PCR. The PCR products were sequenced using the didesoxyterminal method. A sequence of 1039 bps was obtained from the Control Region of 60 specimens, which presented 33 polymorphic sites, 41 haplotypes, Ò» =0.978 and π =0.009. The neutrality tests (D and Fs) were significant (P < 0.05) for most of the populations analyzed. The AMOVA indicated that most of the molecular variation (72%) arises between groups. The fixation index was highly significant (FST = 0.707, P < 0.00001). The phylogenetic analyses indicated that the specimens represented a monophyletic group. Genetic distances between populations varied from 0.8% to 1.9%, and were <0.5% within populations. The degree of genetic differentiation found among the stocks of P. nattereri indicates the need for the development of independent management plans for the different river basins in order to preserve the genetic variability of their populations.


Assuntos
Caraciformes/genética , Haplótipos , Polimorfismo Genético , Animais , Brasil , Dados de Sequência Molecular , Filogenia , Rios , Análise de Sequência de DNA
20.
Braz. j. biol ; 75(4): 838-845, Nov. 2015. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: lil-768192

RESUMO

Abstract The red piranha, Pygocentrus nattereri, is an important resource for artisanal and commercial fisheries. The present study determines the genetic differentiation among P. nattereri populations from the northeastern Brazilian state of Maranhão. The DNA was isolated using a standard phenol-chloroform protocol and the Control Region was amplified by PCR. The PCR products were sequenced using the didesoxyterminal method. A sequence of 1039 bps was obtained from the Control Region of 60 specimens, which presented 33 polymorphic sites, 41 haplotypes, һ =0.978 and π =0.009. The neutrality tests (D and Fs) were significant (P < 0.05) for most of the populations analyzed. The AMOVA indicated that most of the molecular variation (72%) arises between groups. The fixation index was highly significant (FST = 0.707, P < 0.00001). The phylogenetic analyses indicated that the specimens represented a monophyletic group. Genetic distances between populations varied from 0.8% to 1.9%, and were <0.5% within populations. The degree of genetic differentiation found among the stocks of P. nattereri indicates the need for the development of independent management plans for the different river basins in order to preserve the genetic variability of their populations.


Resumo A piranha vermelha, Pygocentrus nattereri, é um recurso importante para pesca artesanal e comercial. O presente estudo determinou a diferenciação genética entre populações de P. nattereri no nordeste do estado brasileiro do Maranhão. O DNA foi isolado utilizando o protocolo de Fenol-clorofórmio e a Região Controle foi amplificada por PCR. Os produtos da PCR foram sequenciados usando o método didesoxiterminal. Uma sequência de 1039 pbs foi obtida da Região Controle de 60 espécimes, que apresentaram 33 sítios polimórficos, 41 haplótipos, һ= 0.978 e π= 0.009. Os testes de neutralidade (D and Fs) foram significativos (P < 0.05) para a maioria das populações analisadas. A AMOVA indicou que a maior parte da variação molecular (72%) surge entre os grupos. O índice de fixação foi altamente significativo (FST = 0.707, P = < 0.00001). As análises filogenéticas indicaram que os espécimes representam um grupo monofilético. Distâncias genéticas entre as populações variaram de 0.8% a 1.9%, e de <0.5% dentro das populações. O grau de diferenciação genética encontrada entre os estoques de P. nattereri indicam a necessidade para o desenvolvimento de planos de manejo independentes para as diferentes bacias hidrográficas, a fim de preservar a variabilidade genética dessas populações.


Assuntos
Animais , Caraciformes/genética , Haplótipos , Polimorfismo Genético , Brasil , Dados de Sequência Molecular , Filogenia , Rios , Análise de Sequência de DNA
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